操作步骤

  1. 将fuseImage导入Imaris
  2. Ctrl+D打开通道面板
  3. 点击Slice测量细胞的直径（取个平均值即可）
  4. 点击Add new Spots（图标为一团黄色的小球） → 点击▶️ → 选择source channel（此处为红色） → 填写直径（此处为1.5µm）→ 点击▶️ → 根据实际情况调整阈值 → 点击绿色箭头 → 点击折线图即可看到整张脑片的细胞计数情况
  5. 点击Add new Surfaces(图标为蓝色的椭球) → 点击Skip automatic creation, edit manually → 界面右侧改为Select → 左下角Draw → 沿着要统计的脑区轮廓绘制闭合曲线 → 点击Create Surface → 点击Edit（图标为一支铅笔✏）选择Mask Selection → 保持勾选Duplicate channel before applying mask → 点击OK之后可以在右侧通道处看到新增的通道（Channel 4） → 取消左侧界面Surfaces的勾选，右侧通道仅保留刚刚复制的通道，其余通道取消勾选 → 接下来对该区域进行细胞计数
  6. 点击Add new Spots（图标为一团黄色的小球） → 点击▶️ → 选择source channel（此处注意改为Channel 4） → 填写直径（此处为1.5µm）→ 点击▶️ → 根据实际情况调整阈值 → 点击绿色箭头 → 点击折线图即可看到特定脑区的细胞计数情况

操作演示

参考文章